Introduction

On distingue classiquement les approches :

  • cladistiques qui portent sur l'analyse individuelle des caractères

  • phénétiques qui interprètent les distances évolutives.

Les approches les plus récentes de phylogénies bayésiennes ou au maximum de vraisemblance combinent l'analyse de caractères et la prise en compte de modèles d'évolution des séquences biologiques.