Introduction à la biologie de l'évolution

L'attraction des longues branches est un artefact^[1] des méthodes phylogénétiques. Il est essentiellement la conséquence du non-respect de l'horloge moléculaire (voir chap 4.2.1). Accumulant plus de substitutions pour un même intervalle de temps, les OTU évoluant plus vite seront de fait plus éloignés des autres OTU, ce qui sera le plus souvent interprété lors de la construction de l'arbre comme la possibilité d'une origine ancienne de cette lignée évolutive. Ainsi, les OTU qui évoluent vite vont avoir tendance à présenter des lignées qui émergent tôt dans les phylogénies et à être regroupés dans l'arbre sans que cela ne reflète leur degré de parenté (fig. 5.60).