5.2.2.1 - Caractères
Un caractère est un attribut observable sur différents spécimens,
que l'on peut caractériser (décrire) de façon non ambiguë
qui possède plusieurs états distincts
Un état est une forme que peut prendre le caractère considéré.
Les différents états d'un caractère sont mutuellement exclusifs (on ne peut pas trouver deux états différents pour un même spécimen)
Exemple de caractères :
caractère : colonne vertébrale ; états : présence, absence
caractère : nombre de doigts ; états : 1, 2, 3, 5 ((fig. 5.30a)
caractère : acide aminé ; état : 20 acides aminés retrouvés dans les systèmes biologiques(fig. 5.30b)
On distingue également
les caractères constants : apparaissent dans le même état (unique) pour tous les OTU considérés
les caractères variables : apparaissent dans plusieurs états (au moins 2) au sein des OTU considérés
les caractères informatifs (fig. 5.31) : caractères variables tels que deux états au moins apparaissent chacun dans au moins deux OTU au sein du jeu de données considéré.
Attention : BOX 6 : Comment identifier des regroupements à partir de caractères ?
Seuls les caractères informatifs permettent de regrouper des OTU dans au moins deux sous-ensembles sur la base de leur ressemblance sur états partagés Dans le cadre de reconstructions phylogénétiques, seules les caractères informatifs seront pris en compte (fig. 5.32).
