A la lumière les microalgues se trouvent dans un état d'équilibre et les concentrations en PGA et RuBP sont constantes. Lors de la transition lumière-obscurité, la production photosynthétique d'ATP et de NADPH s'interrompt et le cycle de Calvin ne peut fonctionner qu'en utilisant les réserves présentes dans le chloroplastes. Ces dernières vont s'épuiser progressivement. Comme il faut de l'ATP pour produire du RuBP à partir du RuP, la consommation de la réserve provoque une diminution progressive de la quantité de RuBP pendant 1,5 minutes environ. La quantité de PGA augmente car sa transformation en triose phosphate est bloquée par le manque de NADPH et d'ATP. Nous pouvons constater qu'il y a environ deux fois plus de PGA qui est formé que de RuBP qui disparaît. Ceci confirme bien la relation quantitative existant entre le RuBP (5+1 atomes de carbone) et le PGA (2x3 atomes de carbone).