Introduction à la biologie de l'évolution

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5.3.2 - Approche phénétique : UPGMA et le neighbor-joining

  • Introduction
  • 5.3.2.1 - UPGMA (Sneath et Sokal 1973)
  • 5.3.2.2 - Neighbor-joining (Saitou et Nei 1987)
  • 5.3.2.3 Exercice d'application de la méthode UPGMA
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  • Introduction
  • 1 - Histoire des théories évolutives
  • 2 - Espèce et spéciation
  • 3 - les moteurs de l'évolution
  • 4 - Vers une vue intégrée des mécanismes de l'évolution
  • 5 - Reconstitution phylogénétique
    • Introduction
    • 5.1 - L'histoire des espèces
    • 5.2 - Origines évolutives et estimation des ressemblances
    • 5.3 - Méthodes de reconstruction phylogénétiques
      • Introduction
      • 5.3.1 - L'approche cladistique : analyse au maximum de parcimonie
      • 5.3.2 - Approche phénétique : UPGMA et le neighbor-joining
        • Introduction
        • 5.3.2.1 - UPGMA (Sneath et Sokal 1973)
        • 5.3.2.2 - Neighbor-joining (Saitou et Nei 1987)
        • 5.3.2.3 Exercice d'application de la méthode UPGMA
      • 5.3.3 - Enracinement d'un arbre
      • 5.3.4 - Evaluation d'une phylogénie : le "bootstrap"
      • ai-je bien assimilé les différents principes de phylogénie ?
    • 5.4 - Interpréter une phylogénie
    • 5.5 - Utiliser le logiciel MEGA pour pratiquer la phylogénie
    • Lectures complémentaires
  • 6 - De la micro à la macroévolution
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